2011年4月25日，珠海大横琴口岸建设开发有限公司在横琴新区正式注册成立。其后，为适应新区对口岸资产经营管理和承接跨境电商业务发展等需要，推动口岸公司由项目公司向口岸综合开发运营商转型发展，公司于2015年7月更名为珠海大横琴口岸实业有限公司，注册资本由500万元增加至5亿元。

随着横琴的开发建设及澳门的快速发展，国内外经横琴口岸往来横琴——澳门两地的人数出现大幅度的增长，而原有的横琴口岸建设标准较低、相关配套不完善无法满足横琴开发建设和远期通关的需要，为促进横琴、澳门两地经济建设和发展，横琴新区于2010年启动横琴口岸建设前期工作。因横琴口岸项目用地与原有口岸用地重合，因此将横琴口岸及综合交通枢细项目分两期建设：一期工程横琴过渡期口岸已于2014年12月建设并投入使用，实行24小时通关。二期工程即横琴口岸主体项目于2016年12月份开工，项目将按照次性总体规划、分期实施、自西向东推进有序建设，已于

2020年8月18日实现横琴口岸新旅检区域的正式开通，2023年9月26日，横琴口岸二期工程客货车联合一站式部分车道开通试运行。

横琴口岸主体项目占地面积34.51万平方米，建筑面积约131万平方米（其中计容建筑面积8443万平方米），投资总估算约为260亿元。主要涵盖三大功能体系: 口岸功能区、综合交通枢纽功能区、口岸综合开发：

1、口岸功能区：横琴口岸的建设将在粤澳创新合作的基础上，建设成为一个集客流、物流于体的“大通关”口岸。在横琴口岸可实现创新旅检通关模式，减少通关时间，大幅提升货车通关速度，为大湾区流通畅保驾护航。

2、综合交通枢纽功能区：强化交通枢纽设施建设，引入以公共交通、轨道交通为主导的交通疏解概念，建立立体化、多层面的交通体系。实现无缝换乘和便捷通关的同时，为整个口岸地区及横琴片区提供良好的交通设施保障，交通设施可满足旅客年通关量8000万人次，日通关量22.2万人次，日通关车辆8000辆次。

3、口岸综合开发区：完善口岸配套服务设施，提升口岸整体服务品质，创新口岸与地块开发联合的运营机制，建设以粤澳台作为背景、口岸为载体、自贸产业为先导、便捷交通为保障的新型口岸综合开发项目。

在大横琴集团公司“城市运营商+产业发展商”发展定位的指引下，口岸公司确立了两大主业：一是横琴口岸及配套设施投资、建设和运营管理，二是现代商贸物流产业和服务业，具体包括三大版块：一是口岸建设与配套商业地产开发运营；二是口岸运维与资产经营；三是商贸物流配套和现代服务业经营。

自成立以来，大横琴口岸公司紧紧围绕两大主业，全力推动横琴口岸主体工程建设，培育口岸经济和商业品牌，初步形成了以口岸建设为中心、以口岸运维为重点、以口岸商业资产经营、商贸物流、现代服务业为核心的业务发展格局。